Absolute Kontraindikationen:

• Tumore
• Spondylitis
• Frische Frakturen
• Luxationen
• Pathologische Veränderungen z.B. ein Os odontoideum
• Manipulationen gegen eine reflektorische Schonhaltung
• Juvenile Osteoporose (in den Abschnitten der schwersten Veränderungen)

Relative Kontraindikationen:

• Hypermobilitäten (Jedoch kommt es von Zeit zu Zeit vor, dass auch hypermobile Segmente Bewegungsirritationen aufweisen welche behandelt werden müssen.)
• Osteoporose, allerdings liegt hier eher das Problem in der Porose
• Vertebrobasiale Insuffizienz (Arteriosklerose oder Verengung des Foramen transversarium durch Arthrose)
• Patienten die den Anschein erwecken "manipulationssüchtig" zu sein
• Akuter Lumbago mit Verdacht auf einen Bandscheibenvorfall
• Relative Kontraindikationen für Manipulationen sind häufige Rezidive binnen kurzer Zeit ohne ersichtlichen Grund
• Das nicht einnehmen können einer sauberen Vorspannung mit Verriegelung
• Während der Schwangerschaft und 6 Monate danach. Durch die hormonelle Umstellung sind behindernde Faktoren für die Manuelle Therapie vorhanden, trotz allem sollte man gut zugängliche Funktionsstörungen nicht unbehandelt lassen.